יעוד קמה בשנת תשנ"ו, מתוך מגמה ליצור שפה משותפת ומגשרת בין עולמה של היהדות הפנימית, הדתית, לעולם הרחב.
המחיצות שקיימות הן ביחסים שבין דתיים ללא דתיים, והן במערכת היחסים של כל בת עם עצמה, אמונתה, ודרכה בעבודת אלוקים.
מקרא ומשנה, גמרא ומחשבה, פילוסופיה ואמנות - ניתנים על ידי טובי המורים, ביניהם מרצים בעלי שיעור קומה מן הרבנות ומן האקדמיה.
המטרה היא לפתח בתלמידות אישיות בעלת שיעור קומה רוחני, אשר תוכל לתת לעצמה ולסובב אותה את המענה לשאלות של אמונה, תורה ויראת שמים מתוך גישה פתוחה וסובלנית, ומתוך היכרות עם גוונים שונים של החברה הישראלית.
עשרות רבות של בנות עברו בשערי המוסד לתוכניותיו השונות, וחוו חוויה של שילוב בין העולמות, תוך בניית עולמן האישי. האווירה במקום הינה משפחתית וחמה, הקשר האישי בין הצוות לבנות ובין הבנות לבין עצמן הינו חברי ותומך, ומהווה נדבך חשוב בבניין עולמה הרוחני של הבת.
בנות יעוד יוצאות גם לפגישות וסיורים עם ציבור חרדי מחד גיסא ובני קיבוצים מאידך גיסא, והמעוניינות בכך - אף מלמדות יהדות בבתי"ס ממלכתיים לא דתיים.
במדרשת יעוד נחשפות הלומדות לעולמות רוחניים מגוונים, גישות שונות לתורה ודרכים רבות לחיות "חיים של אמונה". מטרת הגוון הוא להביא את הבנות לחשיבה עצמאית בוגרת ועיצוב השקפת עולם מתוך ברור פנימי, אישי ומעמיק ולא כחיקוי חיצוני של מודלים קיימים.
מדרשת יעוד מאמינה בחיבור לתורה מתוך מודעות למורכבות החיים ולאתגרי התקופה ומתוך תפיסה שהחיבור לתורה קיים אצל קבוצות שונות ומגוונות בחברה הישראלית. ביעוד נעשה ניסיון לפַתֵח שפה תורנית אשר מתעלה מעל הקודים והסיסמאות של השפה הדתית הרגילה ועל כן מאפשרת מצד אחד - דו שיח עמוק ואמיתי עם העולם החילוני, ומצד שני -· מענה הולם ומעמיק יותר לדילמות הקיומיות שבתוך העולם הדתי.
הקשר עם קבוצות שונות בעם ישראל הוא עיקרון שמחנכים אליו ואף מיישמים אותו במהלך שנת המדרשה בדרכים שונות (שיעורים במערכת, מרצים אורחים, מפגשים, סיורים ועוד).